台湾黑道正道会的朱雀部队专司暗杀，玻璃心（Glass Heart/G•H）正是组织一手培养的顶尖杀手，作风纤细精密，其谨慎程度甚至被人讥为胆小，却能一枪准确命中任何猎物的心脏，射程达六百米以上。在暗杀五十人后，第五十名猎物的女儿无心的几句童语让G•H终于崩溃，无法再继续作为杀人机器的生活。于是她从高楼跃下，让尖锐的铁栏杆贯穿自己心脏。
　　另一方面犽羽獠总算要和槙村香结婚了，婚礼前夜阿香却为了救小孩而车祸身亡，按照阿香生前填写的器官捐赠遗愿，阿香的心脏就被捐了出去。没想到在运送过程竟然被劫，阿香的心脏于是阴错阳差地移植入G•H的身体里。G•H的手术异常成功却迟迟没有醒来，她的意识在抗拒「醒来」这件事， 此时她的内心却响起了阿香的声音——器官移植有时会带有人生前的记忆感情——在阿香的鼓励与安慰下G•H终于苏醒，杀了组织看守人后潜逃，凭着记忆从台湾来到日本新宿－犽羽獠和阿香生活的地方。
　　阿獠自从阿香死后就无心再从事城市猎人（C•H）的工作，留言板也早就从车站撤掉，G•H来到新宿，被城市猎人的暗号XYZ意外勾起回忆，来到车站。却早就不见留言板，失意下走进了海怪（法尔肯）开的猫眼咖啡厅，眼睛看不见的海怪因为G•H行走敲门的方式而误以为她是阿香，于是告诉阿獠：「阿香回来了」——昏倒的G•H却住进了花园诊所。那医生也告诉阿獠G•H许多奇怪的地方－其实G•H就是正道会老大李坚强的女儿香莹，李坚强却一直不知女儿已被组织培育成杀手。
　　在香莹还在休养时，正道会的青龙部队队长私自行动为了想解决香莹而来到新宿，阿獠在知道香莹的心脏就是阿香的心脏后决定保护她，一方面也为了自己的好友——李坚强和其弟李谦德。两方人马对战最终由直属正道会老大的玄武部队歼灭青龙，青龙队长也受到李坚强的处分。
　　香莹在崩溃自杀前累积的罪恶感是从培训时期开始。当时只有代码27的香莹有一个搭档36号，却在最后训练中为生存亲手杀了他。就在此役，应死的36号——本名刘信宏——为了保护香莹不惜背叛青龙，更贴切的说本来信宏就打定为香莹死也在所不惜的主意……本来背叛组织要受到处分，李坚强在测试其对香莹的决心后 决定放他一马，并任其离开组织——（虽然最后还是派了亲信陈先生在他身边监视）信宏就这样在猫眼咖啡厅待了下来，陈先生则在对面开了玄武中华料理餐厅。
　　阿獠和阿香过去曾开玩笑说「拥有阿香捐赠心脏的人就是他们的孩子」，加上李坚强私下拜托，香莹成了阿獠的养女，时不时会显露出阿香母性的一面～回归正常人生活香莹和现实完全脱节，信宏对其苦恋甚笃。
　　一番考验之后香莹成为了新的城市猎人，李坚强则委托陈老在新宿东站口重新树起了留言板。城市传说——XYZ再度出击……